Câu hỏi thường gặp (FAQ’s) để định danh vi sinh vật MALDI-TOF
Khối phổ là gì?
Khối phổ là một kỹ thuật phân tích trong đó các chất hóa học được xác định bằng cách phân loại các ion thể khí trong điện trường và từ trường theo tỷ lệ khối lượng trên điện tích. Trọng lượng phân tử chính xác của mẫu thường có thể được tính toán dựa trên tỷ lệ khối lượng trên điện tích. Bằng cách xác định khối lượng, mẫu có thể được xác định. Accugenix® sử dụng khối phổ MALDI-TOF cho các dịch vụ xác định vi sinh vật AccuPRO-ID®.
Từ viết tắt MALDI-TOF là viết tắt của gì?
MALDI-TOF là viết tắt của Matrix-Assisted Laser Desraction / Ionization-Time of Flight.
Đỉnh ion phân tử trong khối phổ là gì?
Sự bức xạ một điện tử từ một hợp chất trung hòa về điện dẫn đến việc tạo ra một ion phân tử. Ion này cung cấp thông tin về khối lượng phân tử vì khối lượng điện tử rất nhỏ so với khối lượng của phân tử nên khối lượng của ion phân tử được coi là khối lượng của phân tử.
Hệ thống MALDI-TOF nào có thể được sử dụng để xác định các vi sinh vật trong phòng thí nghiệm vi sinh?
Giải pháp Axcess® MALDI-TOF của chúng tôi là sự kết hợp lý tưởng giữa thiết bị chính xác và thư viện vi sinh vật có liên quan để tối đa hóa tỷ lệ định danh trong nhà.
Quy trình xác định vi sinh vật MALDI-TOF là gì?
Quá trình này bắt đầu với một phần nhỏ của khuẩn lạc thử nghiệm * được lắng đọng và bôi lên một điểm chuyên dụng của đĩa để tạo thành một lớp tế bào đồng đều. Sau đó, dung dịch axit hữu cơ được đưa vào để đảm bảo tính toàn vẹn của mẫu.
Dung dịch thứ hai của axit hữu cơ được gọi là “chất nền” sau đó được lắng đọng tại chỗ để bao phủ mẫu. Sau khi làm khô, chất nền đồng kết tinh với các phân tử sinh học có trong vật liệu khuẩn lạc để tạo thành giàn giáo. Các phân tử sinh học bao gồm peptit và protein – những chất phân tích đích trong quá trình này.
Ma trận tạo thành một giàn giáo và cung cấp một nguồn proton để ion hóa và trải qua quá trình chiếu xạ tia UV. Để bảo toàn tính toàn vẹn của mẫu, độ hấp thụ năng lượng tối đa của chất nền phù hợp với độ hấp thụ năng lượng của laser (337 nm). Năng lượng của bức xạ truyền tới mẫu, cho phép giải hấp các hợp chất chính (chuyển trạng thái rắn sang pha khí).
Tiếp theo, mẫu được ion hóa bởi chất nền có tính axit nhẹ (chuyển proton) và các peptit và protein tích điện bắt đầu hành trình của chúng. Sau khi tăng tốc ban đầu khi chúng đi qua trường tĩnh điện, các peptit và protein trôi về phía máy dò với tốc độ được xác định bằng tỷ lệ khối lượng trên điện tích của chúng.
Khi chúng chạm vào bề mặt của máy dò được lót bằng một lớp bán dẫn, các peptit và protein phát ra các xung điện với tốc độ khác nhau, mỗi xung điện sẽ xác định một protein cụ thể.
Một phần chính của thông tin đến từ một phần của các protein ribosome ngoài các protein liên kết DNA cũng như các protein sốc nhiệt. Cùng với các dữ liệu khác, thông tin về thời gian bay (ToF) sau đó được chuyển đổi thành dữ liệu khối phổ được mô tả trực quan dưới dạng một chuỗi các đỉnh khối lượng tạo thành hồ sơ vi sinh vật đặc trưng, còn được gọi là dấu vân tay khối lượng peptit (PMF).
Báo cáo cuối cùng bao gồm danh sách các loài phù hợp nhất được phân loại theo độ tương đồng của dấu vân tay protein, kèm theo một giá trị cho biết mức độ xác định loài hoặc chi an toàn.
* Để có kết quả tốt nhất, chỉ những khuẩn lạc mới phát triển có chứa các tế bào đang phân chia tích cực với protein nguyên vẹn mới phải được thử nghiệm.